《忒修斯之船》讲述了田村心（竹内凉真饰）从一出生起就背负“杀人犯的儿子”的身份，他的父亲佐野文吾（铃木亮平饰）被指控涉嫌投毒杀人，一直坚称自己是无辜的。田村一家人因此遭受到侮辱和歧视，田村渐渐成长为内敛而隐忍的青年。在妻子由纪（上野树里饰）的鼓励下，田村开始调查这起二十八年前尘封的案件，直面自己内心的恐惧。虽然所有证据都指向佐野，但他依然坚称自己是无辜的，这起案件也让田村和他的家人陷入了深深的痛苦之中。